Stata14では日本語問題がだいぶ解決されたようだが、13を使っているためStataはどうにも日本語に弱い。以下のように .do ファイルを実行したら日本語が文字化け。ラベリングなどが台無しになったので対策。
do /Users/なんとかかんとか/hirakitaifile.do
ここによると、日本語はUTFでエンコードしてたらダメで、Shift_JISにする必要があるらしい。そこでテキストエディタ「mi」でdoファイルを開いて、テキストエンコーディングをShift_JISに変更し保存。再度ファイルを実行したら万事解決。